Back

ⓘ অবিচ্ছেদ্য আবরণী প্রোটিন




ইনটিগ্রাল আবরণী আমিষ
                                     

ⓘ ইনটিগ্রাল আবরণী আমিষ

অবিচ্ছেদ্য আবরণী প্রোটিন হচ্ছে জৈব ঝিল্লির সাথে স্থায়ীভাবে সংযুক্ত এক ধরনের আবরণী প্রোটিন । সকল ট্রান্স-আবরণী প্রোটিন -ই আইএমপি এর অন্তর্ভুক্ত, কিন্তু সকল আইএমপি ট্রান্স-আবরণী প্রোটিন নয়। কোন জীবের বংশাণুসমগ্রের নকশায় থাকা উল্লেখযোগ্য সংখ্যক প্রোটিন নিয়ে আইএমপি গঠিত হয়। যেসব প্রোটিন ঝিল্লি অতিক্রম করে, সেগুলো চক্রাকার লিপিড দ্বারা পরিবেষ্টিত থাকে, তাদেরকে আবরণী প্রোটিনের সাথে প্রত্যক্ষ সংযোগে থাকা লিপিড হিসেবে সংজ্ঞায়িত করা হয়। এসব লিপিডকে কেবল পরিষ্কারক, অপোলার দ্রাবক, অথবা কখনো কখনো বিকৃতকারক পদার্থ দ্বারা পৃথক করা যায়।

                                     

1. গঠন

এক্স-রে কেলাসবিদ্যা অথবা নিউক্লীয় চৌম্বক অনুনাদ বর্ণালিবীক্ষণের মাধ্যমে, পারমাণবিক রেজোলিউশনে প্রায় ১৬০টি ভিন্ন ভিন্ন অবিচ্ছেদ্য আবরণী প্রোটিনের ত্রিমাত্রিক গঠন নির্ণয় করা হয়েছে। নিষ্কাশন এবং কেলাসকরণ কঠিন হওয়ার কারণে এগুলো নিয়ে গবেষণা বেশ দূরূহ বিষয়। এছাড়াও, প্রোটিন তথ্য ব্যাংকে পিডিবি অনেক আইএমপি’র পানিতে দ্রবণীয় প্রোটিন ডোমেইন এর গঠন কাঠামো সংরক্ষিত আছে। এদের আবরণের নোঙর হিসেবে বিদ্যমান α − {\displaystyle \alpha -} হেলিক্সসমূহকে, নিষ্কাশন ও কেলাসকরণের সুবিধার্থে অপসারণ করা হয়েছে।

আইএমপি-কে দুটি ভাগে বিভক্ত করা যায়:

  • অবিচ্ছেদ্য মনোটপিক প্রোটিন
  • অবিচ্ছেদ্য পলিটপিক প্রোটিন আন্তঃআবরণী প্রোটিন
                                     

1.1. গঠন অবিচ্ছেদ্য মনোটপিক প্রোটিন

অবিচ্ছেদ্য মনোটপিক প্রোটিনসমূহ এক পাশে ঝিল্লির সাথে সংযুক্ত থাকলেও সম্পূর্ণ দ্বিস্তরী লিপিডজুড়ে বিস্তৃত থাকে না।

                                     

1.2. গঠন প্রোটিনের গঠন নির্ণয়

যুক্তরাষ্ট্রের ন্যাশনাল ইনস্টিটিউট অফ হেল্‌থ জাতীয় স্বাস্থ্য ইনস্টিটিউট এর অধীনস্থ, ন্যাশনাল ইনস্টিটিউট অফ জেনারেল মেডিক্যাল সায়েন্সেস জাতীয় চিকিৎসাবিজ্ঞান ইনস্টিটিউট এর আর্থিক পৃষ্ঠপোষকতায় পরিচালিত একটি প্রকল্প হচ্ছে প্রোটিন কাঠামো উদ্যোগ Protein Structure Initiative, PSI। এর অন্যতম লক্ষ্য হচ্ছে ত্রিমাত্রিক প্রোটিন কাঠামো নির্ণয় এবং আবরণী প্রোটিন-সহ কাঠামোগত জীববিজ্ঞানে প্রয়োগের উদ্দেশ্যে বিভিন্ন কলাকৌশল উদ্ভাবন। হোমোলজি মডেলিং ব্যবহার করে, "লক্ষ্য" অবিচ্ছেদ্য প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড অনুক্রম হতে, পারমাণবিক রেজোলিউশনের মডেল এবং সংশ্লিষ্ট সমগোত্রীয় প্রোটিনের একটি পরীক্ষামূলক ত্রিমাত্রিক কাঠামো গঠন করা যায়। লিগ্যান্ড - জি প্রোটিন-সংযোজিত সংবেদক G-Protein-coupled Receptor, GPCR এবং তাদের জটিল যৌগসমূহের ক্ষেত্রে এই প্রক্রিয়াটি ব্যাপকভাবে ব্যবহৃত হয়েছে।

                                     

2. ক্রিয়া

আইএমপির মধ্যে পরিবাহক transporters, সংযোগকারী, নালীপথ, সংবেদক, উৎসেচক, কাঠামোগত ঝিল্লি-আবদ্ধকারী ডোমেইন, সঞ্চয় ও শক্তি পরিবহনের ইংরেজি: transduction, প্রতিবর্ণী. ট্রান্সডাকশন সাথে সংশ্লিষ্ট প্রোটিন, এবং কোষ সংসক্তি র cell adhesion সাথে জড়িত প্রোটিনসমূহ অন্তর্ভুক্ত। পরিবাহকের শ্রেণিবিন্যাস পাওয়া যাবে পরিবাহক শ্রেণিবিন্যাস তথ্যশালা -তে Transporter Classification Database।

অবিচ্ছেদ্য আবরণী প্রোটিন আইএমপি; এক্ষেত্রে ব্যাকটেরিয়ার আলোক-সংবন্ধনকারী কণা, ব্যাকটেরিওরহোডোপ্‌সিন এবং দ্বিস্তরী লিপিড দ্বারা গঠিত ঝিল্লির মধ্যে সম্পর্কের একটি উদাহরণ নিম্নে উল্লেখ করা হয়েছে:

এক্ষেত্রে, অবিচ্ছেদ্য আবরণী প্রোটিন সম্পূর্ণ দ্বিস্তরী লিপিডকে সাতবার অতিক্রম করে আসে। প্রোটিনের যে অংশ দ্বি-স্তরের পানিবিদ্বেষী hydrophobic অঞ্চলে সংবদ্ধ থাকে, সেগুলো আল্‌ফা হেলিক্যাল এবং তা প্রধানত পানিবিদ্বেষী অ্যামিনো অ্যাসিড দ্বারাই গঠিত। প্রোটিনের C − {\displaystyle {\text{C}}-} প্রান্ত সাইটোসলে থাকে, আর N − {\displaystyle {\text{N}}-} প্রান্ত থাকে কোষের বাইরের অঞ্চলে। যে ঝিল্লি এই নির্দিষ্ট প্রোটিনটি ধারণ করে, তা সালোকসংশ্লেষণে অংশ নিতে পারে।



                                     

3. উদাহরণ

ইন্‌টিগ্রাল বা অবিচ্ছেদ্য আবরণী প্রোটিনের উদাহরণ:

  • ইনসুলিন সংবেদক Insulin receptor
  • গ্লাইকোফোরিন Glycophorin
  • সিডি৩৬ CD36
  • Some types of receptor proteins
  • কতিপয় সংবেদক প্রোটিনসমূহ
  • আয়ন নালী এবং দ্বারসমূহ
  • গ্লুকোজ পার্মিয়েজ Glucose Permease
  • জি প্রোটিন-সংযোজিত সংবেদক যেমন- বেটা-অ্যাডরেনার্জিক সংবেদক
  • সেইপিন
  • কোন কোন কোষ সংসক্তি প্রোটিন অথবা কোষ সংসক্তি অণুসমূহ cell adhesion molecules, CAM, যেমন- ইন্‌টেগ্রিন integrins, ক্যাডেরিন cadherins, স্নায়বিক কোষ সংসক্তি অণু Neural Cell Adhesion Molecules, NCAMs, অথবা সিলেক্‌টিন selectins
  • রোডপ্‌সিন Rhodopsin
  • ব্যান্ড ৩ অ্যানায়ন পরিবহন প্রোটিন Band 3 anion transport protein